Con il suo testamento Giovanni Querini Stampalia fonda un’istituzione a cui affida il compito di “promuovere il culto dei buoni studi, e delle utili discipline”. Ancora oggi è a missione della Fondazione, che ha nella formazione e nello sviluppo della persona ha il suo principale destino. Carlo Scarpa nel 1959 ne ristruttura il piano terra e il giardino.